Frystþurrkun hefur bæði jákvæð og neikvæð áhrif á umhverfið. Á plús hliðinni, miðað við aðrar matvælaverndartækni, notar frystþurrkun minni orku. Það felur í sér ferli sem kallast sublimation, þar sem frosið vatn matvælanna er samstundis snúið að gufu án þess að fara fyrst í gegnum fljótandi fasa. Jafnvel þó að þessi aðferð noti mikla orku á tilteknum stöðum notar hún oft minni orku í heildina en hefðbundnar þurrkunartækni sem kalla á að beita hita í langan tíma. Ennfremur hefur matvæli sem hafa verið fryst - þurrkuð mun lengri geymsluþol og eru létt, sem lágmarkar þörfina fyrir tíðar flutninga og þar af leiðandi kolefnisspor sem tengist dreifingu matvæla.
Engu að síður eru gallar í umhverfismálum við frystingu - þurrkunarferlið sjálft. Bæði fyrstu frysting máltíðarinnar og tómarúmforritið sem þarf til sublimation felur í sér verulega orkunotkun. Hinn háþróaður og kostnaðarsamur gír sem notaður er við frystþurrkun hefur oft í för með sér aukinn umhverfiskostnað framleiðslu og viðhalds. Ennfremur eru umbúðaefnin sem notuð eru til að pakka frystingu - þurrkaðar vörur - venjulega ekki endilega endurvinnanlegar, sem bætir við sóun á plasti og mengun í umhverfinu.
Ennfremur, þar sem hráefni eru fengin til frystingar - þurrkun getur haft áhrif á umhverfið. Ef ávextir og grænmeti koma frá iðnaðar landbúnaði, geta verið vandamál þar á meðal mikil vatnsnotkun, skordýraeitur og niðurbrotinn jarðvegur. Hins vegar er hægt að draga úr þessum áhrifum ef frysta - þurrkaðar vörur koma frá sjálfbærum eða lífrænum bæjum.
Að lokum, frystþurrkun hefur ókosti, þar með talið mikla upphaflega orkunotkun og notkun sem ekki er - endurvinnanlegt umbúðaefni, jafnvel þó að það hafi ákveðna umhverfisávinning eins og orkunýtni og lægri losun flutninga vegna léttra eðlis afurða. Sérstakar aðferðir, efni og hráefni sem notaðar eru í ferlinu geta allar haft veruleg áhrif á heildar umhverfisáhrif frystþurrkunar.
